서울특별시펜싱협회는 1961년 서울특별시체육회 가맹경기단체가 중앙 경기단체로 통폐합됨으로써 대한펜싱협회가 그 역할을 대신해왓습니다. 그러나 1979년 말부터 서울특별시체육회가 가맹경기단체를 재조직함에 따라 1980년3월28일 창립총회를 개최해 협회를 출범시켰습니다. 또한 그 해 5월6일 중앙경기단체인 대한펜싱협회에 승인을 요청해 5월19일 인준을 완료함으로써 본격적으로 사업을 전개하기 시작하였습니다.

1980.04 ~ 1983.12초대회장 : 임천택 회장

1984.01 ~ 1984.12제2대회장 : 윤용득 회장

1987.06 ~ 1988.02제3대회장 : 박기영 회장

1988.02 ~ 1995.04제4대회장 : 장영수 회장

1995.05 ~ 1998.02제5대회장 : 이일쇄 회장

1998.03 ~ 2000.12제6대회장 : 한용초 회장

2001.03 ~ 2002.12제7대회장 : 이재욱 회장

2007.01 ~ 2009.03제8대회장 : 정명철 회장

2009.06 ~ 2010.12제9대회장 : 장대식 회장

2011.02 ~ 2015.03제10 ~ 11대회장 : 김성일 회장

2015.04 ~ 현재제12대회장 : 최태석 회장